合台则公然违抗军令，屡屡趁着夜色，私自率领小股骑兵偷袭城池，每次都因没有后援、准备不足，被城中守军打得大败而归，损兵折将。
两人不仅互不配合，还互相拆台。术赤调配攻城物资，察合台暗中截留；察合台出兵偷袭，术赤故意不派援兵；军中粮草分发、将士调遣，全因二人的矛盾陷入混乱。
城中的秃儿罕太后，通过斥候打探，得知蒙古大军内部兄弟阋墙、军令不一，顿时大喜过望，更加坚定了死守的决心。她不断派出小股精锐骑兵，深夜偷袭蒙古军营，烧毁粮草、斩杀哨兵、破坏攻城器械，搞得蒙古大军人心惶惶，将士疲惫不堪，士气一落千丈。
原本战力强悍的五万蒙古铁骑，因为两位主将的内斗，彻底陷入进退两难的僵局。围攻玉龙杰赤足足三月，蒙古大军死伤过万，却依旧寸步未进，连护城河都没能跨越，战事陷入彻底的停滞。
消息传回撒马尔罕，成吉思汗看着前线送来的战报，得知三个月未能拿下一座孤城，原因竟是自己的两个儿子内讧不休、互相拆台，甚至拿将士性命赌气，当即勃然大怒。
他猛地将战报摔在地上，一脚踹翻面前的沙盘，周身散发的怒意如同寒冰，席卷整个大汗行帐，帐内众将纷纷跪地，低头屏息，无人敢言语。
“逆子！两个逆子！”成吉思汗怒声咆哮，声音震得帐顶旌旗瑟瑟发抖，“大敌当前，不念兄弟情分，不顾西征大业，只知内斗私怨，葬送我蒙古万千将士的性命，简直是我黄金家族的耻辱！是整个蒙古的耻辱！”
耶律楚材连忙上前，躬身劝道：“大汗息怒，龙生九子，各有不同，术赤将军与察合台将军积怨已久，又无统一主帅节制，才酿成此祸。如今之计，唯有立刻派人前往前线，废除三人分权之制，任命一位主帅，总领全军，节制两位将军，统一军令，方能破局。”
成吉思汗深吸一口气，压下心中的滔天怒火，闭上双眼，片刻后再次睁眼，眼神已然恢复冷静。他清楚，三子之中，唯有窝阔台性情宽厚、处事公允，能让术赤、察合台二人信服，也只有他，能化解这场内讧。
“传朕军令！”成吉思汗沉声开口，声音带着不容置疑的威严，“任命窝阔台为围攻玉龙杰赤全军主帅，节制术赤、察合台及所有前线将士，军中一应事务，全由窝阔台决断！再有违抗军令、私自出战、内讧拆台者，无论皇子、将领，一律军法处置，斩