，交通极为不便，这是汉军出征的最大障碍。刘秀下诏命令岭南各郡组织民力，修建从长沙郡通往交趾郡的道路，修复被战乱破坏的桥梁，疏通堵塞的河道，确保军队与物资能够顺利运输。尤其是在“障溪”（指水流湍急、难以通行的溪流）等险要地段，刘秀特意派遣工匠前往指导，修建栈道与渡口，打通了汉军南征的交通要道。
经过两年的精心准备，到建武十八年（公元42年），东汉已具备了平定交趾叛乱的条件。刘秀任命伏波将军马援为主帅，楼船将军段志为副将，调发长沙郡、桂阳郡（今湖南郴州）、零陵郡（今湖南永州）、苍梧郡（今广西梧州）的士兵共计一万余人，正式率军南征交趾。
（三）马援南征：平定叛乱与边疆治理的深化
马援是东汉开国名将，曾西破羌人、北击乌桓，拥有丰富的边疆作战经验，且熟悉南方湿热气候与山地、水网地形，是平定交趾叛乱的最佳人选。临行前，刘秀特意召见马援，叮嘱他“务必安抚民心，不可滥杀无辜”，要求他在平定叛乱后，注重对交趾的治理，而非单纯的采取军事行动。
马援率军抵达岭南后，首先与段志会师，制定了“先取合浦，再攻交趾”的作战计划。当时，合浦郡已被叛军控制，成为叛军的重要物资补给地。马援率领汉军从苍梧郡出发，沿北部湾海岸进军合浦，利用楼船（大型战船）在海上发起突袭，迅速击败了合浦的叛军，收复了合浦郡。随后，马援以合浦为基地，向交趾郡进军。
在进军交趾的过程中，马援充分展现了其卓越的军事才能：他一方面利用战船在交趾的河流中快速机动，突袭叛军的据点；另一方面，他派遣使者前往交趾的少数民族部族，宣传东汉的安抚政策，劝降不愿跟随征氏姐妹叛乱的部族。许多部族首领见汉军势大，又听闻马援的安抚政策，纷纷率领部众投降，叛军的势力逐渐被削弱。
建武十九年（公元43年）夏四月，马援率领汉军抵达交趾郡治所龙编附近，与征氏姐妹的主力部队展开决战。汉军凭借精良的装备与严明的纪律，大败叛军，征侧、征贰姐妹在突围中被汉军斩杀。随后，马援率军追击叛军残部，将其全部击溃，交趾、九真、日南三郡的叛乱彻底平定。
平定叛乱后，马援并未立即撤军，而是按照刘秀的指示，对交趾地区进行了深入治理：
迁徙叛乱首领：为防止叛乱再次发生，马援将参与叛乱的三