“严苛”著称，甚至到了近乎严苛的程度。史书中明确记载，当时“天子勤吏治，俗颇苛刻”“光武承王莽之余，颇以严猛为政”，这种严苛的治理风格虽然在短期内震慑了贪官污吏，却也带来了一系列负面影响，引发了诸多争议。
由于标准过于严苛、处罚过于严厉，许多高官因微小的过失，甚至是毫无过错的情况而受到严惩，导致官场中人人自危，行政氛围趋于紧张。例如，大司徒伏湛作为朝廷最高行政长官之一，仅仅因为没有及时向皇帝报告河南尹与司隶校尉在高庙发生争执这一并非重大失职的事件，便被刘秀罢官；大司徒韩歆性格耿直，多次向刘秀直言进谏，提出不同意见，却因此触怒刘秀，不仅被罢官，最终还在刘秀的责难下自杀身亡；大司徒戴涉因为自己所举荐的太仓令犯了罪，便被牵连入狱，最终死于狱中；大司空宋弘在没有确凿证据的情况下，弹劾上党太守，虽出发点可能是为了整顿吏治，却因证据不足而被罢官；大司空朱浮则因被指控“卖弄国恩”，即利用皇帝的恩宠谋取私利，而被罢官。
这些案例充分体现了刘秀吏治治理的严苛性，也反映出这种治理方式的弊端：一方面，过度严苛的处罚容易导致官员们为了避免犯错而不敢作为，形成“因循守旧、畏首畏尾”的行政作风，不利于政务的积极推进；另一方面，部分处罚缺乏足够的合理性与公正性，容易引发官员群体的不满与抵触，甚至可能导致冤假错案的发生，损害朝廷的公信力。因此，刘秀这种过于严苛的吏治做法，在当时就受到了一些有识之士的批评，认为其“过于严猛，失之于宽”，不利于统治的长期稳定。
六、精简机构：吏员省减与行政效率的提升
除了整顿吏治，刘秀还针对西汉后期以来地方行政机构臃肿、吏员过多、行政效率低下、财政负担沉重的问题，推行了大规模的机构精简改革。建武六年（30年），刘秀正式下令，要求司隶校尉与各州牧分别对自己管辖范围内的地方行政机构与吏员进行核查，凡是县、国（侯国）人口稀少、规模较小，不足以设置完整长吏（县令、县长等）的，可以进行合并，并将合并方案上报大司徒、大司空二府审核批准。
在核查与审核的基础上，刘秀颁布诏书，明确提出“并省四百余县，吏职减损，十置其一”，即一次性合并撤销了四百多个县、国，地方吏员的数量也大幅削减，仅保留