进入最终阶段。整个星系的时空开始坍缩，无数文明的记忆碎片在空中飞舞，被炼化成混沌丹的材料。危急时刻，秦逸的基因共鸣能力突破极限，他的意识与九针器灵融为一体，在虚空中勾勒出《灵枢》记载的“九针归墟图”。九根神针虚影从天而降，分别刺入丹炉的“十二重楼”要害。
当归舰与大黄舰将全部能量注入九针，林婉的烧火棍爆发出历代医者的信念之光，与秦青鸾操控的针灸舟金芒汇聚。当光芒触及古神虚影时，其身上的《黄帝外经》锁链寸寸崩解，露出核心处那团扭曲的“病源意识”。秦逸抓住机会，将自身对生命的理解、对医道的坚守，化作一道纯净的基因之光，直刺病源核心。
“医道的尽头不是毁灭，而是包容！”少年的声音响彻整个星系。在光芒的冲击下，疾厄古神发出不甘的怒吼，丹炉开始逆向运转，将吞噬的能量尽数吐出。混沌药液重新化作星辰，变异的怪物恢复成纯净的能量，大麦哲伦星系在剧烈震荡后，终于重归平静。
尘埃落定，秦逸疲惫地漂浮在虚空中，九针之力缓缓消散。林婉的烧火棍轻轻触碰他的肩膀：“孩子，你做到了。”星孩修复着受损的监测网络，突然惊呼：“检测到宇宙深处还有更多未知的黑暗波动！”秦青鸾驾驶针灸舟回到众人身边，目光坚定：“无论前方是什么，星穹医盟永远不会退缩。”
在遥远的宇宙边缘，一双布满血丝的眼睛透过黑暗凝视着这一切，手中握着一卷写满《黄帝外经》的残破竹简：“有趣但真正的棋局，才刚刚开始。”随着低沉的笑声，空间泛起诡异的涟漪，新的危机正在暗处悄然酝酿。而星穹医盟的成员们，已做好准备，迎接下一次守护宇宙健康的征程。