被清军俘虏，绝食而死，隆武政权也随之灭亡。
然而，南明的抗清斗争并未就此结束。隆武政权覆灭后，桂王朱由榔在广东肇庆称帝，建立永历政权。永历政权得到了大顺军、大西军余部的支持，势力一度有所壮大。其中，大西军将领李定国，堪称南明最后的擎天之柱。李定国作战勇猛，足智多谋，他率领大西军余部与清军展开了激烈战斗，两蹶名王，天下震动。在桂林之战中，李定国大败清军，斩杀定南王孔有德，孔有德走投无路，自焚而死；衡州之战，李定国又设伏击毙敬谨亲王尼堪，这两场大捷，极大地鼓舞了南明军民的士气，让人们看到了抗清胜利的希望。
可就在南明局势稍有转机之时，内部又出现了问题。永历政权内部党派纷争不断，大臣们争权夺利，互相倾轧，严重削弱了抗清力量。而清军则趁机调集重兵，对永历政权发动了全面进攻。李定国虽奋力抵抗，但寡不敌众，永历帝朱由榔被迫逃往缅甸。
清军怎会善罢甘休，吴三桂率领清军进入缅甸，逼迫缅甸国王交出永历帝。永历帝被押解回国后，吴三桂将其绞杀于昆明，永历政权彻底覆灭。至此，南明的抗清斗争以失败告终，清朝基本统一了全国。
在平定南明的同时，清朝统治者也在着手稳固自己的统治。顺治帝亲政后，采取了一系列措施，加强中央集权。他重用汉臣，推行汉化政策，鼓励满汉通婚，促进民族融合；还整顿吏治，严惩贪污腐败，减轻农民赋税，恢复经济生产。在文化方面，尊孔崇儒，以儒家思想为统治思想，开科取士，选拔人才。
然而，顺治帝英年早逝，年仅二十四岁便驾崩了，其子玄烨即位，是为康熙帝。康熙帝即位时年仅八岁，由索尼、苏克萨哈、遏必隆、鳌拜四大臣辅政。起初，四大臣还能齐心协力，辅佐幼主，但随着时间推移，鳌拜逐渐大权独揽，结党营私，飞扬跋扈。他把持朝政，打压异己，甚至公然违抗康熙帝的旨意，朝堂之上人人自危。
康熙帝虽然年幼，但他聪慧过人，早就对鳌拜的专权不满。为了夺回大权，康熙帝暗中培养了一批少年侍卫，每日在宫中练习布库（一种满族传统的摔跤游戏），麻痹鳌拜。等到时机成熟，康熙帝突然下令将鳌拜擒获。鳌拜虽武艺高强，但面对康熙帝精心布置的陷阱，也无