星盟总部的量子防护罩在无声中龟裂，阿依娜的监测系统突然被一片纯粹的黑暗吞噬，只留下一行不断闪烁的猩红文字：「混沌终章启动，倒计时：00:00:00」。林羽的本源之力如坠冰窟，镇魔剑表面的纹路尽数崩解，化作流动的暗物质漩涡，剑身传来的震颤带着足以撕裂灵魂的剧痛。沈梦璃的意识体在本源之力中剧烈扭曲，她的虚影被无数混沌触手缠绕：「这是超越维度管理局的终极存在——『混沌意志』，它要将宇宙彻底回归原初的无序！」
宇宙空间开始以违背逻辑的方式坍缩与膨胀。星系如同被无形巨手揉捏的橡皮泥，恒星被拉扯成扭曲的几何形状，行星在混沌力场中分解成发光的粒子流。物理法则、时间概念、甚至因果关系都在分崩离析，现实与虚幻的界限彻底消失。民众陷入集体性的认知崩溃，有人的身体开始随机重组，有人的意识在不同时空来回跳跃，整个宇宙沦为一场荒诞的混沌盛宴。
林羽紧急召集全宇宙最后的力量，组成「文明火种军团」。但常规武器在混沌力场中瞬间失效，战舰群的能量束发射后便扭曲成毫无意义的螺旋，护盾在接触混沌物质的瞬间就被分解成量子泡沫。阿依娜的声音从断断续续的通讯中传来：「混沌意志正在改写宇宙的底层架构！我们需要找到能锚定秩序的『创世核心』，但它的存在或许只是个传说……」
在穿越混沌星域时，军团遭遇由混沌具象化的「无序使者」。这些怪物没有固定形态，时而化作吞噬一切的黑洞，时而重组为扭曲的时空迷宫，它们的攻击附带「逻辑瓦解」效果，能让任何防御体系陷入自相矛盾的悖论。战斗中，一名战士的战甲在防御与进攻间反复切换，最终自我毁灭；另一位法师的咒语同时生效与失效，引发能量反噬。林羽挥舞镇魔剑，将七种本源之力与文明对秩序的信念融合，创造出能暂时稳定混沌的「秩序之刃」，但剑刃每挥出一次，就会出现一道新的裂痕。
与此同时，星盟的学者们在阿依娜的带领下，从远古文明的残卷中发现惊人线索。「创世核心不是实体，而是所有文明对秩序、希望与生命的集体意志。」阿依娜将破译的古老预言投影出来，「但唤醒它需要全宇宙文明共同做出『永恒抉择』——将自身的存在化作维系秩序的燃料。」