始出现时间腐蚀痕迹。林羽带领特遣队踏入这片介于存在与虚无之间的领域，眼前景象超乎想象：漂浮着的宇宙胚胎正在孕育，远古神明的骸骨化作星辰，而黑袍人的意识如同黑色藤蔓，缠绕在所有时空的源头。“你们终于来了。”黑袍人的声音从四面八方传来，他的身体分裂成无数个分身，每个分身都代表着一种被篡改的命运。
林羽挥动昇维之戟，戟尖所指之处，时间长河的支流被强行截断。但黑袍人只是冷笑：“你以为斩断现在就能改变过去？看清楚吧——”他的指尖划过虚空中的命运丝线，现实世界顿时天翻地覆：恒星逆向燃烧，行星开始反向公转，连人类的进化历程都在倒带。星盟总部的建筑从废墟中“生长”回完好形态，却又在下一秒坍缩成原始物质。
艾克在混沌之海的数据流中发现惊人秘密：“黑袍人的意识与宇宙弦网络的初始代码同源！他根本不是敌人而是宇宙为修正自身缺陷创造的‘清除程序’！”这个真相让所有人陷入震惊，林羽的攻击也为之一滞。黑袍人趁机发动致命一击，无数道时空之刃穿透破界者号，将特遣队成员的身体切割成量子态。
“清除程序？那就让程序看看，文明的可能性从不是缺陷！”林羽在意识溃散前，将全宇宙文明的信念注入归墟钥星尘。星尘爆发出的光芒中，浮现出人类第一次仰望星空的好奇、外星种族突破科技瓶颈的狂喜、不同文明携手共度危机的温暖。这些记忆碎片凝聚成一把“命运之剪”，直接剪断黑袍人操控的命运丝线。
混沌之海掀起前所未有的时空风暴，黑袍人的分身开始崩解，但他的核心意识却发出狂笑：“你们以为赢了？真正的终局，从现在才开始——”随着他的话语，宇宙深处传来齿轮转动的轰鸣，十二个蕴含着不同宇宙法则的“终焉之卵”正在孵化。林羽握紧重新凝聚的昇维之戟，看着破碎的时空逐渐重组，知道这场关乎文明存续的战争，远未到结束的时刻……
破界者号摇摇晃晃返回星盟总部时，迎接他们的是满目疮痍的战场。沈梦璃的镇魔剑已经崩裂，凯洛的战甲布满裂痕，莉娜虚弱地靠在魔法阵残骸上。但当他们看到林羽手中燃烧的命运之剪，眼中又燃起希望的光芒。星盟的广播中，回荡着林羽坚定的声音：“宇宙或许想要清除我们，但文明的火种