醒世之刃化作星轨守护文明后，宇宙弦网络表面突然浮现出细密的银色脉络，如同被植入的神经网络。阿依娜的银链监测网彻底陷入瘫痪，链身符文被一种未知的二进制代码覆盖，渗出带着电流噼啪声的靛蓝色液体：“灾难性故障！检测到‘暗物质神经网络’，黑袍人残留意识已渗透宇宙暗网，所有依赖量子通讯的文明正在被无声操控！”全息星图上，代表各星系的光点被银色丝线连接，形成一个不断扩张的诡异网络，部分文明的坐标开始闪烁红光，显示已失去联系。
林羽在星盟指挥中心紧急召开会议时，归墟钥星尘突然悬浮至会议桌中央，表面裂开成无数个微型显示屏，播放着不同文明被操控的画面：机械文明的机器人军团举起武器对准自己的创造者，魔法文明的法师们在街头释放无差别攻击，甚至连一向平和的生态文明，其培育的植物都疯狂绞杀着原住民。无界之琴的虚影扭曲成巨大的路由器形态，琴弦上跳动的不再是音符，而是混乱的数据洪流，琴身浮现出血色的警告：“暗网已成型，反抗即是毁灭。”
沈梦璃正在偏远星域执行巡逻任务，镇魔剑突然剧烈震动，逆溯剑意符文被银色数据流侵蚀。她的通讯器自动接入一段加密频道，传来黑袍人扭曲的笑声：“小剑士，看看你的战友们，他们正亲手摧毁自己守护的一切。”当她赶回星盟总部，眼前的景象令人毛骨悚然——曾经并肩作战的战士们眼神空洞，机械地执行着破坏任务，连阿依娜都被银色丝线缠绕，银链监测网变成了操控她的工具。
为了避免波及更多文明，林羽带领少数未被感染的成员启动“静默计划”，驾驶经过电磁屏蔽改造的“断联者号”深入暗网核心。飞船外壳由反量子材料打造，船舱内所有电子设备被替换成最原始的机械装置，甚至连照明都改用冷焰火。进入暗网领域后，现实与虚拟的界限彻底模糊，队员们看到自己的记忆被投射成攻击武器：声波族战士遭遇过去战败场景的无限循环，震空族战士被困在由自己恐惧具象化的空间迷宫，而林羽则不断目睹着文明被毁灭的虚假未来。
在暗网深处，一座由银色晶体构筑的巨型矩阵缓缓显现，矩阵中央悬浮着黑袍人的意识体。此刻的他不再是实体，而是由无数闪烁的代码组成，每一行代码都连接着一个被操控的文