贞，镇压平息动乱之后，却纵容他的部将大肆勒索。当地百姓苦不堪言，狄仁杰对此极为不满。他找到张光辅，当面斥责他的错误行为，声称他的罪行比李贞还要严重。张光辅作为宰相，位高权重，狄仁杰的直言让他恼羞成怒。回朝后，张光辅以顶撞宰相的罪名弹劾狄仁杰，导致狄仁杰被贬为复州刺史。尽管遭受了不公正的对待，但狄仁杰始终坚守自己的原则，为了百姓的利益，他毫不畏惧权贵的报复。
三、两度拜相：安邦定国，匡扶社稷
天授二年（691 年）九月，狄仁杰由洛州司马升任地官侍郎，代理尚书事务，并加授同凤阁鸾台平章事，成为宰相。武则天对他十分赏识，曾询问他是否想知道是谁在中伤他。狄仁杰则表示，他更看重武则天对他的看法，只要能为朝廷效力，他不在乎他人的诋毁。他豁达的胸怀和一心为公的态度，得到了武则天的夸奖。
在宰相任上，狄仁杰积极为朝廷建言献策，关注国家的政治、经济和社会发展。当时，太学生请假由皇帝亲自批准，这不仅耗费了皇帝的大量精力，也影响了行政效率。狄仁杰提出太学生请假应由丞相和主簿负责，这一建议既合理又可行，得到了武则天的采纳，优化了朝廷的行政流程，提高了办事效率。
长寿元年（692 年）正月，酷吏来俊臣为了达到自己的政治目的，诬告狄仁杰谋反，导致他被捕入狱。当时律法规定，一被审讯就招供谋反能不判处死刑。狄仁杰深知来俊臣的险恶用心，为了保住性命，以便日后伸冤，他当场承认了谋反罪行。但他并未放弃，趁机将自己的冤情写在帛书里，通过巧妙的方式传递给儿子狄光远。狄光远收到帛书后，立即向武则天呈上，阐述了狄仁杰的冤情。武则天得知后，质问来俊臣，来俊臣却百般抵赖，并指使下属伪造《谢死表》。武则天决定亲自调查，在与狄仁杰的对话中，她了解到了事情的真相。最终，武则天免去了狄仁杰等大臣的死罪，将他们全部调往地方并降职，狄仁杰被贬为彭泽县令。此后，魏王武承嗣屡次请求将狄仁杰杀死，但都被武则天驳回，这也从侧面反映出武则天对狄仁杰的重视。
万岁通天元年（696 年），契丹首领孙万荣攻占冀州，河北出现动乱。武则天起用狄仁杰为魏州刺史。前任刺史为了对抗契丹，