出屯于兴安之西延镇。
是年冬，孙可望在贵阳，假诏敕称秦王，总统天下兵马，召马进忠，马进忠率全军附于孙可望。
1652年，李定国出云南，孙可望令马进忠随定国出师湖南，连战皆捷，大破清军，使南明抗清战局复振。
不过，因为孙可望暗中给李定国拆台，命令冯双礼撤军，冯军撤走，马进忠也随之而走，怒坑李定国一把，使得衡州战役没有取得最大效果。
因为马进忠等人的离去，使得李定国大军要孤军作战，李定国确实是百战名将，顶着尼堪大军的巨大压力，仍然将尼堪击毙，但因为所属兵力不足，只能无奈被迫放弃衡州。
不过也正因如此，马进忠被朝廷解除兵权，最终悲愤成疾，卒于贵阳，结束了自己的一身。