历四月初八（佛诞日），清凉寺都会举行“肉身佛开龛仪式”，信众成千上万，香火鼎盛。
四、清凉寺藏经阁失踪之谜
清代中期，清凉寺藏有万卷古经，包括来自天竺（今印度）的梵文手抄本，以及唐代高僧玄奘亲传法本。寺僧以铜铸锁箱封藏于藏经阁内，外人不得近前。
据民国时期《涿鹿县志》记载，有一夜，天降异象，电闪雷鸣，一股青光从藏经阁腾起，直冲云霄。次日早晨，藏经阁大门无故敞开，万卷古经尽失，铜锁未毁。
民间盛传此事乃“佛书归天”，意在提醒世人佛法无常，不应执着于纸上经卷，而应修于心。
五、观音显灵救村人
清朝咸丰年间，涿鹿县连年干旱，田地龟裂，百姓无以为生。县令求神问卜，得神谕：
“观音在山，清凉之地，龙脉水眼。”
于是百姓结队登黄羊山，在清凉寺观音殿前跪拜三日三夜。忽有僧人梦见观音持柳洒水，指向山腰一处荒石。
众人掘地三尺，果然涌出一泉，清冽甘甜，被称为“观音泉”。至今仍可在寺旁见其遗址，泉水不绝，被奉为“涿鹿第一神泉”。
六、民国抗日，和尚护寺藏人
抗战时期，日军北上占领涿鹿，有意焚毁清凉寺作为“迷信废物”。时任住持“静远法师”手持大悲咒，在庙门口拦截日军坦克，以肉身挡枪口。
据幸存者回忆，日军当时刚要强闯，忽地寺内钟声大作，回音不绝，如天降神鼓。日军慌乱撤退，未再骚扰寺庙。
多年后，法师圆寂，遗体仍保持坐禅姿态，被尊为护国高僧。
七、黄帝显圣，庇佑百姓
相传黄帝每百年都会在清凉寺显灵一次，为百姓解难。一次瘟疫流行，全县病重者无数，医生无策，百姓纷纷跪拜寺中。
夜里一位老妇梦见黄帝着青袍，手持草药一束，说道：
“黄羊山中，苦胆藤、五叶草、石龙胆，合煎服之，可解疫毒。”
妇人醒后带人按梦中指示采药，果然病情好转。后人将此方录为《清凉秘录》，传承至今。
结语：一座寺，一座山，一段民族记忆
清凉寺不仅是一个宗教场