所以他当即就下令道：
“通政司分类后的奏疏，可通过内廷文书房，直接交给分管大学士。”
“每个处的奏疏由一到两位分管的大学士写好票拟后，再由其他大学士处理，并最终由首辅确认。”
“保密司派人担任副厅长，专门负责机密奏疏。”
“军机处的奏疏，可以由分管的大学士直接呈递御前。”
“因为涉及军事机密，存放地图、沙盘的武英殿要专门分出房间，处理军机处事务。”
“所有机密奏疏都要由能接触机密的人负责，并且做好记录。”
“万一出现泄露，朕会严惩不贷！”
对于保密的重要性，朱由检是一再强调。
随着群臣对锦衣卫保密司的适应，保密工作也逐渐深入。
朱由检之前对保密司的设想，正在一一实现。
韩爌听着皇帝和通政使一唱一和，确定这些事情，这让他心中很是有些无奈。
放在以前，通政使这样的小人物根本不被他看在眼里，除了九卿的虚名外，通政使连侍郎都比不上。
但是当今皇帝却给虚名的九卿实权，通政使作为九卿之一，有了参加常参会议、九卿廷推等权力。
如今很多人都认为九卿相比大学士也不遑多让，他这个内阁大学士，面对通政使的时候，也得客客气气。
所以面对吕图南的话，韩爌没有直接反驳，而是认真思索，对自己的利弊。
通政司奏疏分类的事情，让韩爌略微皱了皱眉头。
因为奏疏被通政司分好类别后，首辅就没有了给大学士分配奏疏的权力。这些奏疏会直接交给分管的大学士，首辅只能在其处理好后，进行二次处理。
这是对首辅权力的削弱，对以后的首辅很不利。
同时，皇帝在内阁设立军机处，让负责军事事务的大学士在武英殿处理军事机密，也是对内阁的分化——
时间久了，不在一个地方办公、而且都有票拟权力的两拨人，有可能变成两个衙门。
（内阁在文华殿前方，旁边是制敕房、诰敕房两房。武英殿在皇极门西侧）
这需要的时间可能很长，但是皇帝有足够的耐心。