对于皇帝宽容地免了这些人死罪，刘侨当然赞同。不过对皇帝把熊廷弼和杨镐并列，他却不太同意，这个说法传出去也不能服众，刘侨小心提醒道：
“广宁之失，是辽东经抚不和，时任兵部尚书张鹤鸣偏护王化贞、掣肘熊廷弼。前线最高负责人，其实是王化贞。”
“熊廷弼之事，朝中多有人喊冤。望陛下宽大处理，停止追赃之事。”
朱由检根本不知道还有这件事，听到是梁梦环说熊廷弼侵盗军资十七万，追赃时把熊廷弼长子都逼死了。顿时眉头紧皱，又想到了为天启皇帝摘责任的理由，说道：
“梁梦环是逆案第三等，他说的话怎么能信？”
“熊廷弼案是阉党定的，那就需要重审，把这件事查清楚。”
“他的长子没有罪过却被逼死了，也要给个交待，把相关责任人抓起来。”
又因为王化贞这个实际负责人被自己流放，熊廷弼被传首九边实在太惨，朱由检道：
“让熊廷弼的家人把他的首级拿回去安葬，追叙以往功劳，荫东宁卫百户一人。”
“让礼部为熊廷弼拟谥号，不要苛待曾经立功的人。”
用阉党定罪这个理由给熊廷弼翻案，显示自己仁德。
《崇祯长编》
崇祯元年五月辛酉，朔。
刑科都给事中薛国观言：
王化贞罪与熊廷弼原无轩轾，或欲安顿于东江，或为布置于西部，或共保释于朝中以为申脱化贞之地。何为法之独宽纵乎？
至高出、胡家栋一逃于辽阳，再逃于广宁，今乃欲从末减，恐封疆之臣相寻效尤，接踵以至也。
旨以化贞出等已经屡审所纠，着一并确议。