再好，也还是有不少需要改进的地方的。而爪哇元建立初期，就有不少对内对外的大动作，属于元朝遗留下来的老问题。
最早的时候，大家对于大元的前途，都不怎么看好。如果条件允许，很多人可能就选择直接投降大明了。然而后续发生的几起大案，打消了大家的念头。
明军一开始也对遥远的爪哇没有兴趣。因此，借助早些年在当地经营的种植园，这些人成功在爪哇落脚，甚至还有闲心互相竞争。
元朝灭亡之前，当地就已经很无序了。红巾军四处扩撒之后，元朝维持本土的军事部署都已经很麻烦了，在这边就更加有心无力。和其他地方一样，连表面工作都懒得去做，直接把军权让渡给了地方豪强们。
在爪哇，元朝东南沿海来的大商人，势力处于绝对优势的地位。元军当年攻打爪哇的时候，当地土王还能率众进行反抗。等到元末这会儿，虽然名义上没有什么正规军存在，但这些商人的私兵，比正规元军还狠。
相比大都派来的官员，这些大商人也难缠的多。他们基本都在当地经营了两代人以上，许多年的时间里，一直在这边深耕，早已树大根深。
南洋虽然整体环境恶劣，粗看起来甚至都不太适合人类居住，但这几百年来，随着技术进步，一些肥沃的土地已经可以开发利用了。商人们占据了这些地区，开始种植经济作物，向中原贩售——其实就是取代了之前三佛齐、朱罗这类朝贡国的角色。类比起来，其实就是汉人组成的“外藩”。
而和当地大国一样，他们也组成了自己的“曼荼罗”朝贡网。商港就是他们的王城，种植园和守卫就是他们分封下去的庄园和封臣武装。一方面，他们和不少土王、头人都有勾兑，会借助自己的汉人身份和老家的人脉，带着这些人完成利润更高的对中原贸易；另一方面，借助直属武装，他们也能够压制当地人，必要的时候杀鸡儆猴。
对南洋土人来说，这些更加本地化、融入当地统治秩序的商人集团，比元朝派来的流官和军队，要难搞太多了。由于元朝的充分放任政策，他们能从中原方便地获得武器和补给，不比正规军弱小，能对土人形成碾压；而另一方面，他们又深谙此地的地理、族群分布和矛盾、各个土邦的情况等重要信息，处理起来得心应手。所以短短五十年时间，元朝还没结束，南洋的重要港口，就都被他们占据了。
而南洋土人的另一个